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Talks of 2017

  1. Quelques opacités computationnelles: de la biologie aux décisions humaines


    En biologie expérimentale et théorique, les approches computationnelles prennent une place croissante. Sur la base d’un exemple, j’aborderai les différentes étapes computationnelles entre l’échantillon et la discussion biologique. L’analyse morphométrique est traditionnellement effectuée directement…

  2. Enjeux de l’historicité du vivant pour la modélisation mathématique en biologie


    En physique, les objets sont définis théoriquement par les relations qu'il entretiennent les uns avec les autres. Ce sont ces relations qui sont instanciées dans les modèles mathématiques et qui expliquent le lien profond entre physique et mathématiques. Les modèles mathématique en biologie héritent…

  3. Modeling mammary organogenesis from biological first principles: The default state of cells and its physical constraints.


    The typical approach for mathematical modeling in biology is to apply mathematical tools and concepts which originated from theoretical principles in physics and computer sciences. Instead, the authors propose to construct a mathematical model based on proper biological principles. Specifically, they…

  4. What counterpart to the principle of inertia in Population Genetics ?


    In this paper, we will discuss the notion of inertia in Classical Mechanics and its possible counterparts in Theoretical Population Genetics. We will show that, in Population Genetics, changes take place in a mathematical space whose structure is not compatible with notions such as the conservation…

  5. Les multiples opacités computationnelles en biologie expérimentale et théorique


    En biologie expérimentale et théorique, les approches computationnelles prennent une place croissante. Pour la biologie expérimentale, je discuterai mon expérience dans un laboratoire se focalisant sur la physiologie et le développement des glandes mammaires. J'aborderai les différentes étapes computationnel…

  6. Critique de la raison physico-mathématique en biologie : comment comprendre la morphogénèse chez le vivant?


    Dans cette intervention, nous partirons d'un cas particulier de modèle biophysique de morphogenèse chez les plantes. Nous montrerons que ce modèle permet de comprendre certains aspects du phénomène considéré mais laisse de côté plusieurs aspects clef de la compréhension biologique de la situation :…