Biological evolution involves the appearance of new traits, new phenotypes and new processes but the mathematical understanding of such novelties is still lacking. In this paper, I argue that the notion of a new possibility should be and can be a fundamental notion in biology. This idea has been used in several models but it still lacks a proper mathematical, theoretical and epistemological framework. The notion of new possibility should be analyzed carefully since, like for the notion of probability, points of view a priori and a posteriori cannot be conflated. Moreover possibilities are virtual and it seems at first sight that adding possibilities by a retrospective theoretical move does not change the state of an object. In order to define precisely the notion of new possibilities, I will first discuss a positive notion of possibility which pertains to properties that are properly defined theoretically. This will lead us to a more precise discussion than the set-theoretic language to describe possibilities and enable us to define a robust notion of new possibilities.
We are a group of mathematicians who denounce a mathematization of the world oriented towards purely quantitative analyses and reductionism, rather than invention and construction of understanding. The prevailing use of mathematics as a search for “optimal paths” in economy, biology and general human activities supposes a pre-given universe of possibilities and is suitable for control more than for knowledge construction and a common action. Sometimes, researchers even claim that “computer programs” run organisms’ development and animal or human behavior. We are instead interested in the historical emergence of meaning in changing spaces of possibilities as well as in the production of sense in science and in the personal activity of the researcher. Our current work focuses on historicity, organicity and contextuality of life; on the role of interpretation and meaning in the process of vision; on the importance of interpretation in the applications of mathematics and of a committed analysis of future projections in areas such as finance and ecology. In 2017, we proposed the creation of the association Girolamo Cardano (1501- 1576: inventor of imaginary numbers, first thinker of the transformation of the living in time) that readers are invited to join: http://cardano.visions- des-sciences.eu
Centro Internazionale di Studi Umanistici Umberto Eco, Bologna, Italie
In biology, the molecular biology revolution lead to the prevalence of a linguistic metaphor in the second half of the twentieth century. This metaphor led to a double perspective on secrecy: biologists aimed to unravel the secrets of the living, which would be revealed by reading and decoding DNA, and the secrecy between researchers competing to decode the same "information". This framework is now outdated, both for the understanding of life and in social practice. Biology seems to hesitate between imposing transparency, on both its practices and its objects, and recognizing the existence of several opacities.
Avec l’arrivée des algorithmes en médecine, il y a deux voies possibles. Certains pensent que l’on peut automatiser l’essentiel de la pratique médicale et dans ce cas le médecin deviendra subordonné à la machine. La médecine par la preuve ouvre déjà cette voie en standardisant la décision médicale, même si cette automatisation ne passe pas par une machine. L’alternative consiste à redonner une centralité à l’analyse du médecin et à subordonner l’automatisation et la modélisation à son regard critique. La biologie théorique permet de trancher entre ces deux options et nous conduit à promouvoir la seconde. Pour le comprendre on peut introduire brièvement la question des normes biologiques. Avant la théorie de l’évolution, la théologie naturelle posait l’existence d’un ordre naturel dont les normes, statiques, étaient données par Dieu. À l’opposé, la théorie de l’évolution pose que les normes des organismes ne sont pas statiques et changent au cours du temps. Si l’on raisonne avec des normes fixes, comme dans le cadre de la théologie naturelle, les statistiques sont adéquates pour révéler les normes biologiques. À l’opposé, dans le cadre de l’évolution, le vivant se caractérise par la production de nouvelles normes qui demandent à être analysées dans leurs singularités. Alors, il semble bien que l’analyse statistique, y compris dans sa version sophistiquée sous forme d’IA, soit nécessairement incomplète pour l’analyse des organismes vivants et de la diversité de leurs organisations. Les statistiques ne peuvent donc pas remplacer le jugement du médecin confronté à un individu et ses particularités. Cette brève discussion illustre le fait que l’utilisation rationnelle des moyens numériques ne saurait se passer d’une élaboration théorique en amont. Dans cette rencontre nous allons présenter ces idées et des méthodes pour appréhender les organisations biologiques dans leur complexité.
Avec l’arrivée des algorithmes en médecine, il y a deux voies possibles. Certains pensent que l’on peut automatiser l’essentiel de la pratique médicale et dans ce cas le médecin deviendra subordonné à la machine. La médecine par la preuve ouvre déjà cette voie en standardisant la décision médicale, même si cette automatisation ne passe pas par une machine. L’alternative consiste à redonner une centralité à l’analyse du médecin et à subordonner l’automatisation et la modélisation à son regard critique.
Nicholas Georgescu Rœgen and René Passet, as well as MIT, have emphasized that entropy and negentropy should be central to economic analysis. We will see that this requires us to consider anti-entropy as a dynamic factor, and to specify its role in a contributive economy, according to biology.
XIV Biennial Conference of the Italian Society of Applied and Industrial Mathematics, Rome, Italie
By analogy with theoretical physics, theoretical biology is not limited to mathematical modeling. Instead, theoretical biology should strive to find suitable first principles to ground the understanding of biological phenomena and ultimately frame biological experiments and mathematical models. First principles in physics are discussed in terms of symmetries and the associated conservation principles, on the one side, and optimization on the other side. In biology, we have argued instead that a strong notion of variation is fundamental. This notion encompasses new possibilities and is associated with the historicity of biological phenomena [3]. By contrast, the relative regularity of some aspects of biological organisms should be seen as the consequence of a mutual stabilization by the parts of organisms [2]. In this paper, we will focus on a last aspect which pertains to the way cellular behavior is framed theoretically: should cells of multicellular organisms be considered as spontaneously quiescent so that a stimulation would be required for them to move or proliferate, or should cells be considered as spontaneously moving and proliferating so that quiescence would be the result of constraints. We argue the latter and will show that this assumption can be used to build a model of epithelial morphogenesis in tissue culture.
When doing mathematical modeling, first principles are often interpreted as physical principles of conservation. In this paper, I show that properly biological first principles can also be introduced and used. Discussing this question can bring more coherence to the field and show that implicit, opposite assumptions are often made.
Nous vous invitons à une seconde rencontre du groupe Cardano. Dans le contexte de l’anthropocène, il nous semble particulièrement utile d’interroger le rôle des mathématiques. Entre la toxicité propre aux produits chimiques non régulés et l’utilisation des mathématiques dans les marchés financiers, on réfléchira également au rôle de ces dernières pour appréhender la soutenabilité des transitions en cours.
Face à l’automatisation de l’emploi et à la numérisation de l’économie, comment mettre le numérique au service d’une nouvelle économie locale, durable et contributive, en y associant une réflexion plus large prenant en compte l’éducation, le vivre-ensemble et l’urbanité ?
