Systématique et biologie générale: un défi épistémologique

Si la systématique permet de nommer les êtres vivants que les autres disciplines de la biologie étudient, ce qui implique une dépendance logique, force est de constater que ses concepts sont plus rarement mobilisés. Nous argumenterons que l'une des raisons de cette situation est une contradiction épistémologique profonde entre les raisonnements historiques au coeur de la systématique phylogénétique et les raisonnements relationnels ou synchroniques, que la plupart des autres disciplines de la biologie mobilisent. Autrement dit, les biologistes et écologues décrivent leurs objets par leurs histoires - au moins en partie et parfois implicitement - mais ils sont intéressés à comprendre ce qu'ils font dans une situation donnée. Nous poserons que cette difficulté ne peut être surmontée par un cadre épistémologiquement uniforme. Alors, la biologie demande une épistémologie hybride, articulant raisonnements historiques et raisonnement relationnels ou synchroniques. Clarifier cette situation, présente de fait dans les raisonnements biologiques, et tirer parti de cette épistémologie hybride demande des développements théoriques, épistémologiques et formels.